آيت‌الله گلپايگاني و حادثه 19 دي
دكتر باهر مسوول و رئيس وقت بيمارستان آيت‌الله گلپايگاني در قم مي‌گويد كه ساواك از او خواسته بود اجساد شهداي 19 دي را به آنها داده و علت كشته شدن آنان را دعواي دسته جمعي گزارش كنند نه اصابت گلوله. او در خاطرات خود مي‌گويد:
... من وقتي مطلب دستم آمد، گفتم بايد بروم مقتولين را ببينم... داخل شدم و شهدا را برانداز كردم. 3 نفر بودند... وقتي از اتاق خارج شدم، به مامورين ساواك گفتم: من آثار ضربه آجر در اينها نديدم. به نظرم گلوله خورده‌اند. شروع كرديم به جر و بحث كردن در آخر گفتند: ما از شما مي‌خواهيم ترتيبي بدهيد كه اين اجساد به ما تحويل داده شود... گفتم: من چنين اجازه‌اي ندارم. چون مدير و سرپرست اصلي بيمارستان، حضرت آيت‌الله گلپايگاني است... گفتند برو به آقا تلفن كن!... آقا فرمود: مطلقا اين كار را نكنيد و به هيچ‌وجه تحويل اينها ندهيد در مقابلشان بايست و بگو آقا اجازه نداد ما اجساد را از اينجا تكان بدهيم... ساواكي‌ها كه دستشان به جايي بند نشد، رفتند.
حماسه 19 دي قم 1356؛ خاطرات دكتر غلامرضا باهر، به كوشش علي شيرخاني، مركز اسناد انقلاب اسلامي، ص 58.
مخالفت همه مراجع
پس از انتشار مقاله توهين‌آميز به امام امت، طلاب ناراحت و خشمگين در روز 18 دي 1356 به منزل مرحوم آيت‌الله العظمي گلپايگاني (ره) رفتند و آن مرجع فقيد مراتب ناراحتي و نارضايتي و خشم خويش را ابراز نمود گزارشگر ساواك از آن سخنراني اين گونه گزارش مي‌دهد:
ديشب روزنامه را برايم خواندند. خيلي ناراحت شدم. مدتي است كه به دين و روحانيت جسارت مي‌كنند. بعد [حضرت آيت‌الله گلپايگاني] طلبه‌ها را نصيحت كرد كه بايد متحد باشيد، اختلاف را كنار بگذاريد، اختلاف بين ما از آمدن كارتر به ايران بدتر و زيان‌آورتر است. آنها از اختلافات ما استفاده مي‌كنند. قبل از اين‌كه شما بياييد من داشتم نامه مي‌نوشتم براي آيت‌الله خوانساري كه جلو اين كارها را بگيرد چون شخصا با دستگاه رابطه ندارم. درس‌ها را تعطيل كرديم ولي نبايد كه به همين جا اكتفا كنيم، ما بايد با آقايان ديگر هم صحبت كنيم تا آنها هم با ما اقدام كنند.
امام با اين حرف‌ها كوچك نمي‌شود
خبرچين ساواك در ادامه، از تجمع در منزل مرحوم آيت‌الله العظمي نجفي مرعشي چنين گزارش مي‌دهد:
طلبه‌ها در منزل آيت‌الله نجفي جمع شدند. آيت‌الله نجفي سخنراني كرده و گفت: من ايشان را (خميني را) خوب مي‌شناسم.. با هم رفيق هستيم، ايشان با اين حرف‌ها كوچك نمي‌شود، من اقداماتي كرده‌ام... .